Пинежский заповедник был создан 20 августа 1974 года по инициативе Ботанического института Академии наук СССР имени Владимира Комарова.
Особенность территории – уникальные крупные карстовые лога и провалы с водопадами и колодцами. В его пределах находятся около 140 пещер с общей протяжённостью 50 километров. Сотка – самая крупная река заповедной территории.
Пинежский заповедник – это северная тайга, большой нетронутый массив лиственничных лесов, сотни чистейших озёр и уникальные карстовые пещеры Беломорско-Кулойского плато. На Пинежье сохранилось рекордное для европейской тайги количество видов реликтовых растений. На территории заповедника обнаружено 506 видов сосудистых растений, 278 мхов, 152 вида лишайников, 391 вид афиллофоровых грибов. Здесь охраняется около трети редких для региона видов растений и грибов, произрастают 10 видов сосудистых растений, грибов и лишайников, внесённых в Красную книгу России.
На особо охраняемой природной территории зафиксировано 36 видов млекопитающих и 157 видов птиц. Более трети видов беспозвоночных и позвоночных животных, обитающих в заповеднике, занесены в Красную книгу Архангельской области.
– Территория заповедника интересна тем, что раньше здесь было дно моря, – сказал заместитель председателя правительства Архангельской области Игорь Мураев. – Здесь карстующиеся породы максимально близки к поверхности, а где-то полностью выходят наружу. Наша задача – сохранить это уникальное место.
В охранной зоне заповедника уже несколько десятилетий развивается экологический туризм. Особой популярностью у гостей пользуются экскурсии по экологическим тропам и маршрутам «Водопад на Святом ручье», «Пещера Певческая эстрада», «Березниковские пещеры», «Малая Голубинская», «Лог Тараканья Щелья», «Река Карьела» и другие.
Один из традиционных и популярных эколого-просветительских проектов заповедника – ежегодный конкурс «Птица года». А в посёлке Голубино сотрудники заповедника почти 30 лет организуют экологические лагеря для школьников.
